Lancet Oncol:肾透明细胞癌与肥胖断言相关的转录组特征分析

2022-01-31 06:11:08 来源:
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一.研究工作背景

成年人与小肠透明线粒棒状胰脏 (ccRCC)的高风险增大有关,但成年人又矛盾地与该的预后缓解有关,其潜在前提尚不确切。现所写对成年人病征和单单现异常肥胖病征在原发和糙周饲料三组织里的腹腔分解成和免疫核苷酸三组关联性开展研究工作量化。

本文讲解了端粒酶惹来的微环境的关联性借以暗示成年人病征的猎食竞争者(成年人猜想)。

二.量化步骤三.撰文讲解1.COMPARZ函数调用、TCGA-KIRC函数调用、MSK免疫治疗函数调用数据库查阅、矫正

在COMPARZ函数调用的453名病征里,有375名(83%)病征兼具比如说的Matrix数据库,治疗前BMI测量以及无进展和总棒状猎食数据库开展量化(请注意1)。除119名(26%)超载病征外,来自COMPARZ检验的事与愿违函数调用之外256名(68%)病征(n=256)。

请注意1.COMPARZ医学检验函数调用的人均收入博弈论和医学外观上

TCGA-KIRC函数调用里的332事例病征里,审核了经小肠切除术治疗的152事例(46%)中晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病征的医学和人均收入博弈论数据库(请注意2)。在排除59名(39%)超载病征后,最后获得的函数调用之外93名病征(n=93)。

请注意2.中晚期透明线粒棒状小肠线粒棒状胰脏TCGA-KIRC函数调用的流行病学和医学外观上

从62事例MSK四周饲料三组织函数调用里开展小肠脏切除术的非转移性透明线粒棒状RCC病征里获得了原发性和四周饲料电子束。在这个函数调用里,从59名病征的PNN(小肠周周围)四周饲料,25名病征的PNA(避开小肠周)四周饲料以及55名病征的三组织里取样。在排除超载病征此后,事与愿违函数调用之外41名(69%)PNN试样病征, PNA试样为17(68%),试样为37(67%)。从最初的203名进行者的MSK免疫治疗研究工作人一组里排除74名(36%)超载病征后,总猎食量化的事与愿违函数调用之外129名(64%)进行者(请注意3)(n=129)。

请注意3. 运用于MSK免疫治疗的医学检验函数调用的人均收入博弈论和医学外观上

2.成年人的小肠透明线粒棒状胰脏病征相对于单单现异常肥胖的小肠透明线粒棒状胰脏病征总猎食期极短

根据KM猎食量化,在三三组里都找到成年人病征的总猎食期极短。在TCGA-KIRC函数调用里,经分期测量仪器后,成年人病征的总棒状存活期长于单单现异常肥胖三组;在COMPARZ函数调用里,经IMDC高风险满分测量仪器后,胖病征的总棒状存活期也长于单单现异常肥胖三组。在MSK免疫疗法函数调用里,经IMDC高风险满分测量仪器后,BMI与死亡率的无显着关联性(如三幅1)。

三幅1.TCGA-KIRC函数调用 (A)、COMPARZ 函数调用(B)和MSK免疫治疗函数调用(C)的总猎食期

3.COMPARZ函数调用里成年人病征兼具更高的PFS

对CPMPARZ函数调用KM量化后,KM弧线说明了,COMPARZ函数调用里成年人病征比单单现异常肥胖病征兼具更高的PFS。

三幅S1.COMPARZ函数调用里成年人病征比单单现异常肥胖病征兼具更高的PFS

4.用作前沿药物治疗,成年人病征仍兼具更高的OS

KM弧线说明了了在用作前沿过氧化物趋化因子衍生物(pazopanib或Sunitinib)的两个治疗三组里,成年人病征的OS仍然较单单现异常肥胖病征好。

三幅S2.COMPARZ函数调用用作前沿药物治疗三组的总猎食期量化

5.COMPARZ函数调用里,成年人与单单现异常肥胖的病征核苷酸三组遗传外观上发挥关键作用显着关联性

做完上述量化,所写在三个函数调用里确认成年人猜想发挥关键作用此后,在此之后在COMPARZ函数调用里对成年人和单单现异常肥胖病征审核了核苷酸三组学关联性。先是做了Hallmark遗传集的GSEA量化,比起成年人病征与单单现异常肥胖病征之时有的关联性:成年人病征里说明了缺氧、TGF-β、上皮-时有充质转变和腹腔分解成信号通路显着挂钩,提示伤口愈合捷径的激活(三幅A)。三幅B是对三幅A筛选的几个端粒酶通路的Enrichment plots。

三幅S4.COMPARZ函数调用里成年人病征与单单现异常肥胖病征的ccRCC核苷酸三组遗传外观上发挥关键作用显着关联性

6.COMPARZ函数调用与TCGA-KIRC函数调用 里成年人比单单现异常肥胖病征的腹腔分解成满分高

在GESA衍生的外观上遗传集腹腔分解成满分比起里,成年人病征高于单单现异常肥胖病征(如三幅2)。

三幅2.COMPARZ函数调用(A)与TCGA-KIRC函数调用 (B)里成年人原发病征与单单现异常肥胖病征的腹腔分解成的z score

7.单单现异常肥胖与成年人病征的免疫线粒棒状一组无显着关联性

对单单现异常肥胖(7事例)与成年人(16事例)病征的原发的主要免疫线粒棒状数量均运用于流式线粒棒状术开展审核。三幅A说明了了成年人病征与单单现异常病征之时有的免疫线粒棒状一组的总棒状关联性。三幅B确切说明了了成年人和单单现异常肥胖病征T线粒棒状一组的伴生水平。找到单单现异常肥胖与成年人病征的免疫线粒棒状一组无显着关联性,免疫线粒棒状伴生的程度与BMI无关。

三幅S9.用流式线粒棒状术量化单单现异常肥胖与成年人病征的免疫线粒棒状一组无显着关联性

8.与单单现异常肥胖病征相比,成年人病征糙周饲料三组织发炎增大,尤其是周围的糙周饲料

在MSK的非转移性ccRCC病征的前瞻性函数调用里,所写合并了20个最显着的丰富的IPA规章通路,这些通路来自于成年人和单单现异常肥胖病征的PNN和PNA试样的比起(三幅A)。成年人和单单现异常肥胖病征的PNN和PNA试样之时有的免疫伴生(ssGSEA满分)比起(三幅B)。

三幅S5.与单单现异常肥胖的病征相比,成年人病征的小肠周饲料说明了单单发炎和缺氧增大

综上,在COMPARZ检验函数调用里,经过IMDC高风险满分调整后,找到相对于单单现异常肥胖病征,过氧化物趋化因子衍生物治疗提高了成年人病征的猎食率,尤其是拒绝接受sunitinib治疗的病征。IMDC高风险满分三维相关联的反应物时有接反映寄生虫环境因素对乳腺胰脏系统性发炎关键作用(事例如贫血,游离粒线粒棒状增多,和血小板增多症),这些环境因素有可能也是免疫治疗结果和BMI之时有关联前提的原因。找到成年人病征的腹腔分解成分数高于单单现异常肥胖病征,与之前其他的研究工作结果请注意明的,进行腹腔分解成,β-氧化捷径等等遗传的富集的现象一致。因此,腹腔分解成的关联性可以大部分暗示成年人病征拒绝接受过氧化物趋化因子衍生物治疗后的较好预后。

此研究工作为成年人猜想发放了生物学默许。在患有ccRCC的病征观察到成年人病征相对于单单现异常肥胖的病征微环境的关联性:尤其是成年人病征的的腹腔分解成增大,但总棒状发炎无显着关联性。相比较的是成年人病征的四周饲料说明了增大的发炎和缺氧状况。透明线粒棒状胰脏与糙周饲料三组织微环境的复杂相互关键作用有可能兼具医学意义,有一点进一步研究工作。

更早单单处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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