Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地绘制出人类肠道的旋生态系统目录!

2022-01-03 04:42:16 来源:
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近日,一项登出在国际杂志Nature Biotechnology上并作“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的深入研究报告中的,来自中的欧分子药理学麻省理工学院等管理机构的科学研究们通过深入研究将生命肾脏菌种三组中的所有仅有的菌种真核生物选集成了一个大型的资料库,从而就能希望深入研究部门深入即使菌种基因和蛋白之间的关连性,以及其对生命生活品质的影响。

菌种遍布肾脏外,其尽可能产生蛋白来影响机体进食、生活品质和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体菌种三第一组的数量要比人体细胞还要多,包含菌种、真菌和其它菌种;为了认知菌种在生命药理学中的所扮演的关键因素片中的,科学研究们通常会在麻省理工学院中的裂解并对其培养,随后在对菌种完成DNA基因组,然而在此之前很多菌种还没有在麻省理工学院的周围环境中的被培养繁殖。

为了拿到这些菌种的相关文档,深入研究部门采取了另外一种方式,他们从周围环境中的(比如肾脏)收集也就是说样本,随后在对整个样本中的的DNA完成基因组,然后数据处理方式对来自也就是说样本中的的数千种品种的个体真核生物完成修复,这种方式被叫作宏真核药理学新技术,该新技术能作为一种替代方式对单个品种的DNA完成裂解和基因组。

深入研究成果Rob Finn问到,本年包含我们在内的三个独立一个团队修复了数以百计个肾脏菌种三组真核生物,而仅次于的问题就是这些一个团队所给予的结果到底有着能力也,以及到底能将这些结果选集成为一个更加全面的表单。在此之前深入研究部门已经从生命肾脏中的超过4600种菌种栖地中的选集了20万个真核生物和1.7亿个蛋白序列,这种新型的资料库(确立的生命胃肾脏真核生物可数和确立的胃肾脏蛋白书目)探究了机体肾脏的巨大多元性,并为进一步完成肾脏菌种三组深入研究铺平了道路。

深入研究成果描画出的这个巨大的书目是菌种三组深入研究的一个里程碑,预见或将能为科学研究们提供者更加宝贵的自然资源来深入研究生命肾脏生态系统中的每一种菌种所扮演的关键因素片中的。这项深入研究说明,超过70%被检测到的菌种从而在麻省理工学院中的被成功培养过,而其在体外的活性仍然未确定,而这类菌种中的仅次于的人群就是Comantemales;深入研究成果问到,看到Comantemales如此广泛真是一个惊喜,这就凸显了我们的确对肾脏中的的菌种知之甚少,我希望这个书目能希望生物文档学家和分子药理学家在预见几年弥补这一知识空白。

该资料库/书目收集的所有资料都能在该网站自然资源Mgnify中的拿到,其能希望科学研究们比对菌种的真核生物资料并且与当前的资料库完成对比;随着世界各地深入研究一个团队不断披露新资料库,该书目可能会扩大到包含其它机体躯干的菌种三组,比如皮肤或呼吸道结构上等躯干。先前深入研究成果问到,这一书目的选集预见或为细菌学和临床深入研究部门提供者更加丰富的自然资源,然而深入研究部门可能会在南美洲、亚洲和非洲等代表性不足的地区见到更多新菌种品种,在此之前深入研究部门并不吻合不同人群中的菌种多元性的差异和变化情形。

原始出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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