Mol Cell:张锋再造三合一组合抗病毒的新型CRISPR Cas13子系统

近日，加州大学伯克利分校和哈佛大学Broad深入研究所获知向其：Pardis C. Sabeti、张锋等科学家联合开发不止一种新型的抗真菌感染控制系统。世界上有许多相似的危险病原体都是基于脱氧激核糖体RNA的病毒感染，有趣埃博拉病毒感染、山后的卡病毒感染和HIV感染。该控制系统在CRISPR Cas13新技术的思路再次强化，可用以样品和破坏生命体蛋白中都兼具脱氧激核糖体RNA的病毒感染。该深入研究登载在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR控制系统为抗真菌感染步骤造成黎明之前，张锋开发团队的深入研究职员凭借着CRISPR/Cas9控制系统为加固免疫控制系统抵抗真菌感染并吞造成属于自己愿意。然而，并吞生命体的病毒感染相当多变，即使是在同一可作种内，也能大幅度前提利用环境。因此我们需要非常灵巧的预防性病毒感染的平台。为了探求属于自己抗真菌感染解决方案，深入研究职员将目光投向了CRISPR Cas13控制系统，Cas13核糖体可以天然地特异性细菌中都的病毒感染RNA。它可以对RNA进行面向对象，从病毒感染胶体中都去除特定的激核糖体序列。尽管CRISPR Cas13控制系统几乎存在一些局限普遍性，但是该步骤在研究所中都易于加载，并且之前张锋开发团队的深入研究职员在哺乳动可作蛋白中都早就进行了前提的试验中证明了。深入研究职员开发了一种名为CARVER的新型的平台，它能将Cas13细胞内的病毒感染RNA催化与基于Cas13的较快诊断读数结合起来，使用特定的高灵敏度核糖体报告分子解锁（SHERLOCK）的平台，样品消灭基于RNA的病毒感染。创建个旧的控制系统深入研究职员首先筛选了350多个生命体就其病毒感染（HAV）DNA，以鉴定Cas13可以直接特异性的病毒感染RNA序列。他们主要寻找的是既更易突变，又最这样一来在切割后停用病毒感染的录像。病毒感染DNA中都潜在的Cas13最大限度位点哈佛大学Cameron Sabeti研究所的英国剑桥大学Myhrvold博士指不止：“理论上，你可以面向对象Cas13来攻击病毒感染的任何部分。但是可作种内部和可作种之间都有庞大的多样普遍性，随着病毒感染的进化，几乎DNA都发生了急剧的变化。如果你不小心翼翼，你似乎会追求最终从未效果的最大限度。”然后，他们通过量度归纳测序数据，以确定数百种病毒感染可作种中都的数千个潜在位点，这些位点似乎是Cas13的直接靶标。接下来，深入研究职员所设计了该控制系统的Cas13监督RNA。新面向对象的Cas13在感染了淋巴蛋白普遍性脉络膜脑膜炎病毒感染（LCMV）、甲型HIV感染（IAV）和粘液普遍性口炎病毒感染（VSV）的生命体蛋白中都进行了试验中检测。将Cas13引入样品后24小时，深入研究职员观察到培养可作中都病毒感染RNA的水平减少了40倍。随后，深入研究职员检查了Cas1消除病毒感染感染普遍性的能力。深入研究数据推测：病毒感染暴露后八小时，Cas13将HIV感染的感染力减少了300倍以上。之前，该开发团队使用SHERLOCK样品新技术来动态测量Cas13特异性后的病毒感染RNA水平。该样品控制系统包括了有关治果的较快反馈以及有关特定病毒感染突变的接收者。摘录对于病毒感染感染的疗法，虽然早就批准了90多种抗病可作，但它们只能疗法9种结核病。总体而言，只有16种病毒感染兼具FDA批准的疫苗。因此，找寻系统地的抗真菌感染步骤显得尤为重要。该深入研究的第一作者 Catherine Freije 指不止：“Cas13可以是一种深入研究工具，来探求生命体蛋白中都病毒感染生可作学的许多上都，它也似乎是一种临床工具，用以诊断样本，疗法病毒感染感染，并计量疗法的直接普遍性——所有这些都能让CARVER在属于自己或耐药普遍性病毒感染浮现时急剧前提利用和应对。”原始原文:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]